超越人類『標記』的速度!

AI已經廣泛應用在我們的生活中,除了自動駕駛、智慧工廠、人臉辨識等等,生醫科技的應用案例如春筍般的出現。這次要分享的是透過AI模型,「即時」對動態影像進行神經元的自動切割,超越目前人工切割影像的準確度與速度。

來自美國杜克大學的研究團隊,針對鈣指示劑和雙光子顯微鏡生成的影像,進行自動化的動態神經元切割,透過簡化版的UNET模型達到高速且不失準確度的目的。

看到圖一所示,影像資料的預處理是十分重要的一步,透過將信噪比最大化,在透過時間綠波以及二值化將資訊合併到2D圖像中,UNET模型的訓練輸出「活動神經元」的空間分佈機率圖,將機率圖閾值化後,最後將每一張圖片的活動神經元分群,即可知道上一幀與下一幀的移動狀況,就能辦到追蹤活動神經元運動的過程。

影片中是SUNS(研究團隊開發的演算法)這是結合上面所述的靜態UNET分割出神經元後,結合每一幀去呈現的動態活動神經元追蹤技術,可以看見右邊的追蹤功能,可以圈選出活動中神經元的先後順序,並且自背景中切割出來。

目前SUNS算法對於動態活動神經元切割的速度與精確度是最高的,幾乎可以取代人類執行這類繁複的工作。現代科學發展不斷創新、改良模型與資料格式,未來就無需人類替機械學習「標記答案」,甚至AI還能協助改良模型呢!


撰文:許楷翊


參考文獻:
Bao, Y., Soltanian-Zadeh, S., Farsiu, S. et al. Segmentation of neurons from fluorescence calcium recordings beyond real time. Nat Mach Intell 3, 590–600 (2021). https://doi.org/10.1038/s42256-021-00342-x

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