基於SLEAP系統的果蠅行為長期追蹤與節律分析

這篇論文使用SLEAP深度學習框架,成功地捕捉了果蠅的長期行為數據,並對其行為模式進行了詳細分析。透過紅外線和12小時的光照循環,持續監控47隻果蠅,長達7天,捕捉了果蠅的姿態變化,最終產生了約20億個數據點。這些高解析度的數據提供了果蠅在各種行為模式下的全方位分析。

果蠅的晝夜規律與老化效應。實驗發現,果蠅的行為有顯著的晝夜變化。白天果蠅表現出較高的活躍度,從事清潔、移動等行為,尤其是在早晨開燈的第一小時,這些行為達到高峰;而夜間則顯示出明顯的靜止狀態。
圖1.記錄了不同行為的訊號,以及經過時間變化之後的結果

隨著實驗進行,尤其是在第4天後,果蠅的活動逐漸減少,靜止時間明顯增長,這種變化顯示出衰老的行為特徵。此外,果蠅的進食頻率和行走速度隨著實驗的進行逐漸下降,晝夜行為模式的差異也隨之減少。
圖2.紀錄果蠅在第四天之後,行為上的變化

這篇論文除了揭示果蠅的行為節律外,也展示了SLEAP系統的技術創新,成功解決了長期、高解析度數據記錄與分析的挑戰。通過主成分分析(PCA)和成分數據分析,研究團隊可以深入解析果蠅在長時間尺度下的行為變化,為行為生物學及衰老研究提供了重要數據與工具。


撰文:李庚翰


原始論文:McKenzie-Smith, Grace C., et al. "Capturing continuous, long timescale behavioral changes in Drosophila melanogaster postural data." ArXiv (2023).

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